Віртуальний скринінг та прогноз ADME параметрів ряду 5- арилідензаміщених похідних роданіну з бензотіазольним фрагментом у молекулах
DOI:
https://doi.org/10.37987/1997-9894.2024.9-10(285-286).328466Ключові слова:
in silico скринінг, бензтіазолзаміщений 2-тіоксотіазолідин-4-oн (роданін), 5-ариліденові замісники, ADME властивості, SwissADME, взаємозв’язок «структура – активність»Анотація
При розробці нових лікарських засобів важливі знання про ADME профіль молекул. Перед початком синтезу доцільно визначити цінність сполук для медичної хімії, спрогнозувати їх біо- та синтетичну доступність, оцінити ймовірну «лікоподібність» та поведінку молекул в організмі людини.
Мета дослідження – здійснити in silico прогнозування ADME параметрів 5- ариліденпохідних N-(4- оксо-2-тіоксотіазолідин-3-іл)-2-(2-оксобензо[d]тіазол-3(2H)-іл)ацетаміду на основі їх молекулярної структури.
Матеріали і методи. Вільно доступний веб-сервіс SwissADME для визначення фізико-хімічних, фармакокінетичних показників молекул, параметрів їх лікоподібності та придатності для цілей медичної хімії.
Результати. Продовжуючи наші попередні дослідження, ми провели віртуальний скринінг ряду сполук з метою визначення їх властивостей та перспективності для медичної хімії. Для сполуки 8 прогнозується найкращий ADME профіль. Усі досліджені сполуки характеризуються достатніми «лікоподібними» властивостями з помірною біодоступністю та нескладним синтезом.
Висновки. Результати in silico прогнозування окреслюють план подальших дій щодо цілеспрямованого синтезу сполук та експериментального підтвердження одержаних даних. Для оптимізації ADME профілю планується проведення структурної модифікації сполук. Перспективним напрямком вбачаємо модифікацію 5-ариліденового фрагменту шляхом введення потенційних «фармакофорних» груп. Пошуки зі знаходження фармакологічно активних сполук серед похідних роданіну з бензтіазольним фрагментом тривають.
Посилання
n silico molecular docking in DNA aptamer development / T. N. Navien, R. Thevendran, H. Y. Hamdani [et al.] // Biochimie. – 2021. – Vol. 180. – P. 54–67. DOI: 10.1016/j.biochi.2020.10.005.
Synthe sis and anticancer activity evaluation of 4-thiazolidinones containing benzothiazole moiety / D. Havrylyuk, L. Mosula, B. Zimenkovsky [et al.] // European Journal of Medicinal Chemistry. – 2010. – Vol. 45, Issue 11. – P. 5012–5021. DOI: 10.1016/j.ejmech.2010.08.008.
Synthe sis and antitumor activity of novel 2-thioxo-4-thiazolidinones with benzothiazole moieties / L. Mosula B. Zimenkovsky, D. Havrylyuk [et al.] // Farmacia. – 2009. – Vol. 57, No. 3. – P. 321–330. URL: https://farmaciajournal.com/arhiva/20093/issue32009art08.pdf.
Rhodan ine-Based 4-(furan-2-yl)benzoic Acids As Inhibitors of Xanthine Oxidase / A.V. Beiko, O. L. Kobzar, M. V. Kachaeva [et al.] // Ukrainica Bioorganica Acta. – 2023. – Vol. 18, No. 2. – P. 31–40. DOI: 10.15407/bioorganica2023.02.031.
Синтез нових 5-заміщених 2-піразолілтіазол-4-онів як потенційних біологічно активних сполук / І. М. Юшин, А. В. Лозинський, О- М. В. Федусевич [та ін.] // Актуальні питання фармацевтичної і медичної науки та практики. – 2020. – Т. 13, № 2 (33). – С. 214–218. DOI: 10.14739/2409-2932.2020.2.207117.
Yadav R. Recent advances in the synthesis of new benzothiazole based antitubercular compounds / R. Yadav, D. Meena, R. Sagar // RSC Adv. – 2023. Vol. 13, Issue 32. – P. 21890–21925. DOI: 10.1039/D3RA03862A.
Synthe sis and biological activities of benzothiazole derivatives: A review / K. P. Yadav, Md-A. Rahman, S. Nishad [et al.] // Intelligent Pharmacy. – 2023. – Vol. 1, Issue 3. – P. 122–132. DOI: 10.1016/j.ipha.2023.06.001.
Клені на О. В. Використання баз даних хемоінформатики та біоінформатики у процесах комп’ютерного конструювання ліків (огляд) / О. В. Кленіна, Т. І. Чабан // Фармацевтичний журнал. – 2023. – Т. 78, № 6. – С. 61– 82. DOI: https://doi.org/10.32352/0367-3057.6.23.05.
In sil ico methods and tools for drug discovery / B. Shaker, S. Ahmad, J. Lee [et al.] // Comput Biol Med. – 2021. – Vol. 137. – Р. 104851. DOI: 10.1016/j.compbiomed.2021.104851.
SwissA DME. Available from: http://www.swissadme.ch/.
Daina A. Swiss ADME: а free web tool to evaluate pharmacokinetics, druglikeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules / A. Daina, O. Michielin, V. Zoete // Sci Rep. – 2017. – Vol. 7. – P. 42717. DOI: 10.1038/srep42717.
Nguyen T. T. Pharmaceutical Formulations with P-Glycoprotein Inhibitory Effect as Promising Approaches for Enhancing Oral Drug Absorption and Bioavailability / T. T. Nguyen, V. A. Duong, H. J. Maeng // Pharmaceutics. – 2021. – Vol. 13, No. 7. – P. 1103. URL: https://doi.org/10.3390/pharmaceutics13071103.
Synthe sis, CYP 450 evaluation, and docking simulation of novel 4-aminopyridine and coumarin derivatives / H. G. Ghalehshahi, S. Balalaie, H. R. Sohbati [et al.] // Arch. Pharm. Weinheim. – 2019. – Vol. 352, No. 3. – P. e1800247. DOI: https://doi.org/10.1002/ardp.201800247.
Inhibi tion and induction of CYP enzymes in humans: an update / J. Hakkola, J. Hukkanen, M. Turpeinen, O. Pelkonen // Arch Toxicol. – 2020. – Vol. 94 (11). – P. 3671–3722. DOI: 10.1007/s00204-020-02936-7.
Lesyk R. Drug design: 4-thiazolidinones applications. Part 1. Synthetic routes to the drug-like molecules / R. Lesyk // Journal of Medical Science. – 2020. – Vol. 89 (1). – P. 33–49. DOI: 10.20883/medical.406.
Facile synthesis of 5-arylidene rhodanine derivatives using Na2SO3 as an ecofriendly catalyst. Access to 2-mercapto-3-aryl-acrylic acids and a benzoxaborole derivative / C. Boureghda, R. Boulcina, V. Dorcet [et al.] // Tetrahedron Letters. – 2021. – Vol. 62. – P. 152690. DOI: 10.1016/j.tetlet.2020.152690.
